60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0937 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1162    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  31.65 
 
 
530 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  29.87 
 
 
572 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  30.73 
 
 
481 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  29.52 
 
 
449 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  29.93 
 
 
471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  27.79 
 
 
455 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  27.98 
 
 
453 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  30.34 
 
 
460 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  29.82 
 
 
473 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  29.3 
 
 
553 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  29.3 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  30.38 
 
 
561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  30.47 
 
 
463 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  30.47 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  29.91 
 
 
463 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  28.5 
 
 
509 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  27.84 
 
 
502 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  26.47 
 
 
488 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  29.34 
 
 
514 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  27.32 
 
 
491 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  28.57 
 
 
488 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  26.23 
 
 
488 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  26.23 
 
 
488 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  27.07 
 
 
491 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  27.83 
 
 
514 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  27.3 
 
 
477 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.18 
 
 
580 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  31 
 
 
231 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  27.62 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  30.77 
 
 
512 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  30.77 
 
 
512 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  29.82 
 
 
427 aa  94  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  25.13 
 
 
555 aa  94  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  26.17 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  29.04 
 
 
510 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  24.32 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23.61 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  24.61 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  25.69 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  25.69 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  25.71 
 
 
498 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  25.54 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  26.22 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  25.58 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  27.37 
 
 
473 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  27.64 
 
 
508 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  27.64 
 
 
508 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.41 
 
 
464 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  24.76 
 
 
472 aa  60.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  25.9 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  24.88 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  23.37 
 
 
428 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  27.95 
 
 
518 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  28.57 
 
 
455 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  23.43 
 
 
400 aa  50.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  26.27 
 
 
406 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  21.72 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3039  hypothetical protein  25.97 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0289115  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5403  hypothetical protein  30.23 
 
 
519 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>