48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2407 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  877    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  61.28 
 
 		 464 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  46.61 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  45.64 
 
 		 508 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  45.41 
 
 		 508 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  45.31 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  46.15 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  46.15 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  43.98 
 
 		 514 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  43.26 
 
 		 498 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  36.21 
 
 		 472 aa  225  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  29.31 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  27.18 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  26.34 
 
 		 511 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 530 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.53 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.61 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.1 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  26.32 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  26.49 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  25.89 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  25.15 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  25.45 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  25.45 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  26.68 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  24.01 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  27.01 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  26.02 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  28.66 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  23.76 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  23.84 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  22.95 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  22.95 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  24.16 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  22.95 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  26.85 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  23.82 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  26.77 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  26.91 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  25.97 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  25.97 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  22.49 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  23.63 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  28.51 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  26.69 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  27.09 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  25.22 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>