41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3959 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1049    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  99.42 
 
 
513 aa  1040    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  61.11 
 
 
473 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  60.04 
 
 
508 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  59.83 
 
 
508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  61.18 
 
 
498 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  55.6 
 
 
514 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  48.11 
 
 
440 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  43.05 
 
 
464 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  45.92 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  37.64 
 
 
472 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  29.84 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  29.42 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  29.93 
 
 
580 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  25.69 
 
 
564 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  24.29 
 
 
514 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  25.2 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  24.66 
 
 
492 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  25.27 
 
 
510 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  25.33 
 
 
529 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  25.14 
 
 
477 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  25.34 
 
 
512 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  25.34 
 
 
512 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  25.19 
 
 
530 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.54 
 
 
572 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  23.62 
 
 
455 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  25.2 
 
 
553 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  24.4 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  26.51 
 
 
471 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  25.07 
 
 
561 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  24.77 
 
 
453 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  24.64 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  25.72 
 
 
463 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  23.82 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  25.18 
 
 
463 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  28.1 
 
 
571 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  27.13 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  26.59 
 
 
502 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  23.62 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  25.18 
 
 
460 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  23.2 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>