48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5456 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  935    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  44.57 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  39.82 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  35.24 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  34.79 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  36.1 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  32.6 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  31.42 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  31.26 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.71 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  32.15 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  31.79 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  34.34 
 
 		 473 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  31.55 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  31.09 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  29.72 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  31.02 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  30.3 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  31.03 
 
 		 553 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  31.03 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  29.6 
 
 		 487 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  32.53 
 
 		 561 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  30.16 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  30.16 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  29.7 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  28.15 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  37.39 
 
 		 231 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  28.15 
 
 		 463 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  27.69 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.98 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  28.61 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  25.84 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  25 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  25.65 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23.3 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  23.87 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  24.77 
 
 		 513 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  24.77 
 
 		 514 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  24.49 
 
 		 580 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  25.64 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  25.65 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  35.05 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  29.44 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  23.71 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  28.83 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>