52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0692 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  63.52 
 
 
514 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  68.33 
 
 
491 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  61.87 
 
 
514 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  97.5 
 
 
561 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1101    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  69 
 
 
491 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  70.02 
 
 
480 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  74.25 
 
 
509 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  67.57 
 
 
487 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  73.78 
 
 
502 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  66.3 
 
 
492 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  97.54 
 
 
529 aa  946    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  68.28 
 
 
488 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  68.51 
 
 
488 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  68.51 
 
 
488 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  68.97 
 
 
510 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  68.97 
 
 
512 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  68.97 
 
 
512 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  60 
 
 
473 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  59.53 
 
 
477 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  58.49 
 
 
488 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  33.54 
 
 
463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  32.5 
 
 
463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  33.88 
 
 
463 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  35.46 
 
 
471 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  35.51 
 
 
449 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  35.83 
 
 
530 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  31.76 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  31.03 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  34.58 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  29.44 
 
 
460 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  31.84 
 
 
469 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  27.1 
 
 
475 aa  153  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.96 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.87 
 
 
564 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  28.13 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  33.02 
 
 
231 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.16 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.06 
 
 
464 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  25.2 
 
 
513 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  25.2 
 
 
514 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  38.37 
 
 
187 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  25.5 
 
 
514 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  26.79 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  22.97 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  29.59 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  26.6 
 
 
472 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  25.8 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  35.44 
 
 
474 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  22.41 
 
 
464 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  28.87 
 
 
130 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>