48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3144 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  977    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  66.9 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  62.34 
 
 		 477 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  58.72 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  57.99 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  58.72 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  58.49 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  57.76 
 
 		 514 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  54.66 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  58.03 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  58.72 
 
 		 529 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  58.49 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  57.91 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  57.67 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  55.65 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  58.72 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  54.59 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  54.11 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  54.59 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  54.59 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  54.11 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  37.12 
 
 		 530 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  32.39 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  32.39 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  31.55 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  33.18 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  31.42 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  28.22 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  30.93 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  27.1 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  26.2 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  28.81 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  33.03 
 
 		 231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 564 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.85 
 
 		 572 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.91 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  41.38 
 
 		 187 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  27 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  22.51 
 
 		 580 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  25.37 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  26.42 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  45.83 
 
 		 130 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  22.48 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  23.11 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  27.05 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23.32 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  27.05 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>