48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2317 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1180    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  29.87 
 
 		 564 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  27.01 
 
 		 530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  27.93 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  29.57 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  29.7 
 
 		 553 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  29.57 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  24.88 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  27.14 
 
 		 502 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  28.46 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  28.46 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  28.46 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  27.39 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.81 
 
 		 580 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  26.4 
 
 		 455 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  28.46 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  26.88 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  26.51 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  27.46 
 
 		 510 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  27.85 
 
 		 488 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  28.35 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  26.9 
 
 		 477 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  26.7 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  26.4 
 
 		 512 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  26.4 
 
 		 512 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  25.74 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  25.65 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  23.65 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  26.47 
 
 		 473 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  25.25 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  27.81 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  27.49 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  27.22 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  25.83 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  24.31 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  30.34 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  26.56 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  26.54 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  26.54 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  26.74 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  25.29 
 
 		 440 aa  55.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  22.93 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  26.94 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  25.95 
 
 		 498 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  24.84 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  24.54 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  24.42 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  23.48 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>