50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0191 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  68.25 
 
 		 491 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  68.81 
 
 		 488 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  77.01 
 
 		 512 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  68.48 
 
 		 491 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  76.42 
 
 		 514 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  68.81 
 
 		 488 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  77.01 
 
 		 512 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  996    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  71.99 
 
 		 502 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  72.64 
 
 		 509 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  73.17 
 
 		 480 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  77.01 
 
 		 510 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  68.58 
 
 		 488 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  75.05 
 
 		 492 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  72.49 
 
 		 514 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  67.57 
 
 		 529 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  67.57 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  67.8 
 
 		 561 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  58.06 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  55.22 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  57.58 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  31.85 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  31.85 
 
 		 463 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  34.94 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  32.08 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  31.83 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  32.71 
 
 		 449 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  31.88 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  29.6 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  31.86 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  28.8 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  28.63 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.74 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  28.37 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  32.57 
 
 		 231 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.17 
 
 		 564 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  25.25 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  25 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.14 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  34.96 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  24.4 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  24.4 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  28.29 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  26.86 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23.19 
 
 		 511 aa  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  23.22 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  22.77 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  22.6 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  44.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  23.41 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>