41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1129 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  62.45 
 
 		 498 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1051    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  59.96 
 
 		 514 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  59.73 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  57.88 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  57.43 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  57.21 
 
 		 508 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  45.02 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  43.75 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  40.54 
 
 		 464 aa  289  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  37.1 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  28.67 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  26.48 
 
 		 511 aa  93.2  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.92 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  27.09 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.22 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  24.21 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  26.58 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  25.79 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  25.78 
 
 		 529 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  25.5 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  25.5 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  27.43 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  22.93 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  26.49 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  25.37 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  25.93 
 
 		 514 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  24.86 
 
 		 463 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  24.41 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  24.41 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  24.41 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  23.22 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  29.01 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  24.24 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  31.68 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  22.64 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  24.94 
 
 		 481 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  22.64 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>