48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0508 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1194    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  47.85 
 
 		 511 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  29.95 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  29.73 
 
 		 514 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  26.11 
 
 		 472 aa  104  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  26.23 
 
 		 449 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.81 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.68 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.18 
 
 		 564 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  28.43 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  30.08 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  29.46 
 
 		 508 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  25.93 
 
 		 530 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  29.64 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  26.92 
 
 		 514 aa  90.1  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  26.68 
 
 		 441 aa  88.6  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  24.26 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  23.83 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  23.53 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  23.52 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  24.7 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  24.51 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  25.26 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  25.9 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  26.16 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  24.21 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  26.16 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  24.45 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  24.45 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  24.7 
 
 		 463 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  23.38 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  26.41 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  24.4 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  22.94 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  22.68 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  24.65 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  25.37 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  23.33 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  23.14 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  21.84 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  23.62 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  25.25 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  22.51 
 
 		 488 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  24.49 
 
 		 453 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  22.08 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  22.08 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  22.08 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  25.13 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>