35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0904 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1018    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  62.45 
 
 		 514 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  61.18 
 
 		 514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  60.96 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  55.92 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  56.33 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  56.11 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  45.05 
 
 		 440 aa  355  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  39.74 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  42.79 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  35.35 
 
 		 472 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  29.13 
 
 		 428 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  28.43 
 
 		 580 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  26.76 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  25.71 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  26.18 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  26.22 
 
 		 455 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  29.91 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  26.79 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  26.79 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  26.48 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  23.51 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  25.95 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  28.91 
 
 		 571 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  27.1 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  26.12 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  25.4 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  28.06 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  32.73 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  40.98 
 
 		 510 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  27.13 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  40.98 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  40.98 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  27.34 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>