48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4275 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  44.15 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  41.19 
 
 		 530 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  38.29 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  36.46 
 
 		 449 aa  312  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  32.74 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  32.33 
 
 		 509 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  31.79 
 
 		 480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  31.76 
 
 		 553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  31.76 
 
 		 529 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  34.04 
 
 		 561 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  30.37 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  30.1 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  32.2 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  31.68 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  29.91 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  31.88 
 
 		 487 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  31.35 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  31.35 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  33.24 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  33.16 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  32.97 
 
 		 510 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  32.63 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  32.63 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  28.05 
 
 		 477 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  29.48 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  28.22 
 
 		 488 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  26.13 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.79 
 
 		 564 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  27.84 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.4 
 
 		 572 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  22.78 
 
 		 475 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  24.21 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  22.45 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  23.6 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  26.22 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  23.6 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  22.68 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  24.56 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  24.36 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  24.36 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  22.92 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  24.25 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>