49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5830 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  69 
 
 		 553 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  69.23 
 
 		 529 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  66.15 
 
 		 492 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  85.01 
 
 		 488 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  79.59 
 
 		 480 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  97.35 
 
 		 491 aa  926    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  64.26 
 
 		 514 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  66.11 
 
 		 487 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  84.39 
 
 		 488 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1001    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  85.01 
 
 		 488 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  63.78 
 
 		 514 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  69 
 
 		 561 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  68.05 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  67.59 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  66.74 
 
 		 510 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  66.51 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  66.51 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  57.67 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  57.14 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  54.11 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  35.94 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  34.56 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.56 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  34.7 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  35.17 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  30.37 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  31.7 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  31.55 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  31.34 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  30.31 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  28.98 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  27.01 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.87 
 
 		 481 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  31.86 
 
 		 231 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.07 
 
 		 564 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.81 
 
 		 572 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  28.04 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  38.37 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  25.93 
 
 		 464 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  24.45 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  25.07 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  24.66 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  23.32 
 
 		 580 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  22.07 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  23.38 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  32.73 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  22.76 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  31.86 
 
 		 511 aa  43.5  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>