29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01810 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  34.19 
 
 
514 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  33.61 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  32.93 
 
 
492 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  39.62 
 
 
514 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  38.68 
 
 
512 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  38.68 
 
 
512 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  38.68 
 
 
510 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  34.96 
 
 
487 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  37.74 
 
 
502 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  41.38 
 
 
488 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  40.7 
 
 
480 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  39.08 
 
 
477 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  35.85 
 
 
509 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  38.37 
 
 
491 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  37.21 
 
 
491 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  37.21 
 
 
488 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  38.37 
 
 
561 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  38.37 
 
 
553 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  37.21 
 
 
488 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  37.21 
 
 
488 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  38.37 
 
 
529 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  36.78 
 
 
473 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  28.35 
 
 
449 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  27.27 
 
 
471 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  28.83 
 
 
453 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  29.17 
 
 
455 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  39.22 
 
 
463 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  39.22 
 
 
463 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>