12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2438 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1097    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2220  hypothetical protein  62.62 
 
 		 536 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000188992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1282  hypothetical protein  56.51 
 
 		 530 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2192  hypothetical protein  51.92 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056207  normal  0.0113602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  42.6 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  24.75 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  31.09 
 
 		 467 aa  53.9  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  34 
 
 		 476 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  35.09 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  30.97 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  27.83 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  24.65 
 
 		 231 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>