24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2220 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1092    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000188992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2438  hypothetical protein  62.62 
 
 		 534 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1282  hypothetical protein  54.78 
 
 		 530 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2192  hypothetical protein  51.82 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056207  normal  0.0113602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  47.84 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  31 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  31.5 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  26.56 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  25.58 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  27.34 
 
 		 578 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  30.6 
 
 		 476 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  26.52 
 
 		 639 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  21.68 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  27.33 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  24.35 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  30.63 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  25.42 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  26.27 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25.58 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  24.41 
 
 		 624 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  24.58 
 
 		 571 aa  43.5  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  26.15 
 
 		 643 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  27.12 
 
 		 622 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>