156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2386 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2386  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 60 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000162869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  40 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  41.38 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  43.64 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2631  transposase IS3/IS911 family protein  39.62 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  44.64 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  44.64 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  44.64 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  52.08 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  52.08 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  43.64 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  43.64 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  43.64 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  38.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  38.89 
 
 		 357 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  40 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  40 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  38.18 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2585  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  39.29 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.91 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.91 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.91 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  42.59 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  40.74 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>