97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2585 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2585  transposase IS3/IS911  100 
 
 
87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  44.29 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  44.29 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  44.29 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  45.07 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  46.48 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04490  transposase IS3/IS911  38.24 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  39.71 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  39.71 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  39.71 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1193  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.062228  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  37.5 
 
 
293 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  40.35 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1290  ISCps2, transposase orfA  36.67 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  37.78 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  36.62 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2386  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000162869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  32.89 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  32.89 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2631  transposase IS3/IS911 family protein  31.03 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  31.88 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  30.43 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3042  ISBma4, transposase  34.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2532  ISBma4, transposase  34.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.409059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2249  ISBma4, transposase  34.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2165  ISBma4, transposase  34.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  31.88 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  38.24 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  43.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  40.85 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  41.43 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  41.43 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  41.43 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  38.24 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  29.58 
 
 
357 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  38.24 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  41.43 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  30.88 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  30.99 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  32.88 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  30.88 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  32.88 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  32.88 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  48.78 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  32.88 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  36.76 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  42 
 
 
56 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  40.85 
 
 
99 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  40.85 
 
 
99 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 
103 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>