More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C60 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C60  transposase  100 
 
 		 357 aa  738    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C02  transposase  92.27 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0639  IS5 family transposase orfB  63.6 
 
 		 273 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  100 
 
 		 96 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  98.96 
 
 		 96 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  98.96 
 
 		 96 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  39.91 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  39.55 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  37.96 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  38.12 
 
 		 255 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  38.12 
 
 		 255 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  34.3 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  35.91 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  35.91 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  35.91 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  35.45 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  35.54 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  35.48 
 
 		 277 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  37.04 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  37.04 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  35.48 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  35.48 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  35.48 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  33.18 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  33.03 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 285 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  30.45 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  30.45 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  30.45 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  33.98 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  35.65 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  35.65 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  35.65 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  35.02 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  35.32 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  35.32 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  35.32 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  32.37 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  32.37 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  32.37 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  32.37 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  32.37 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  35.32 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  35.32 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  40 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  35.32 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  37.07 
 
 		 270 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  33.8 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  37.07 
 
 		 270 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  33.76 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>