More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4466 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4466  integrase, catalytic region  100 
 
 		 104 aa  217  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  100 
 
 		 304 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  100 
 
 		 304 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 301 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  52.69 
 
 		 296 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7055  hypothetical protein  48.86 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.50306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  48.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  48.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  48.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  48.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  48.84 
 
 		 291 aa  88.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.84 
 
 		 277 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 269 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 180 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  48.19 
 
 		 294 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.25 
 
 		 296 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.25 
 
 		 296 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  50 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  45.98 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.18 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  46.91 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  44.57 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  42.71 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  42.71 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  42.71 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  50 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  50 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  50 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  46.81 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  45.56 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4612  transposase  50.68 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  0.0596523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3747  ISRSO8-transposase orfB protein  48.78 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.916581  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  46.32 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  48.19 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  48.78 
 
 		 272 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3750  putative transposase B  49.38 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  43.33 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  42.55 
 
 		 274 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  43.18 
 
 		 279 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.55 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  46.43 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  46.43 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  46.43 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  46.43 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>