More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2121 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.41 
 
 
993 aa  1039    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
1019 aa  2001    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4297  Glycine--tRNA ligase  61.49 
 
 
1024 aa  1141    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83812  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29834  predicted protein  44.79 
 
 
1051 aa  776    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.93436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1275  glycine--tRNA ligase  76.34 
 
 
1017 aa  1437    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.208463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  61.25 
 
 
991 aa  1123    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1038  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  64.55 
 
 
987 aa  1162    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0178  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits  31.5 
 
 
1003 aa  522  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.05 
 
 
687 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.22 
 
 
687 aa  406  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.7 
 
 
698 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.32 
 
 
690 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.8 
 
 
687 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
687 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.82 
 
 
691 aa  403  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  39.48 
 
 
688 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.34 
 
 
695 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
686 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.01 
 
 
687 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.36 
 
 
690 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.11 
 
 
691 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
686 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  33.57 
 
 
688 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
690 aa  375  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.82 
 
 
694 aa  376  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.95 
 
 
693 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.5 
 
 
685 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.44 
 
 
705 aa  370  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  38.31 
 
 
691 aa  370  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.9 
 
 
688 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.68 
 
 
688 aa  366  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  38.54 
 
 
693 aa  365  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.2 
 
 
728 aa  361  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.81 
 
 
696 aa  362  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.49 
 
 
702 aa  360  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.53 
 
 
696 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.52 
 
 
693 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.42 
 
 
684 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
297 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
292 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.43 
 
 
684 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.86 
 
 
697 aa  355  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.55 
 
 
289 aa  356  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.09 
 
 
684 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.94 
 
 
684 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
291 aa  354  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.8 
 
 
694 aa  353  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.59 
 
 
687 aa  353  8e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.88 
 
 
680 aa  353  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.17 
 
 
684 aa  352  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.71 
 
 
684 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.95 
 
 
684 aa  352  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.9 
 
 
294 aa  351  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 
711 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 
711 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.64 
 
 
291 aa  350  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.57 
 
 
685 aa  350  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
292 aa  350  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.7 
 
 
292 aa  350  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
291 aa  350  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  37.34 
 
 
696 aa  348  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.9 
 
 
693 aa  347  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.24 
 
 
291 aa  346  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.01 
 
 
291 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
291 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
719 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.8 
 
 
296 aa  346  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.75 
 
 
683 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
294 aa  345  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
290 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  54.9 
 
 
293 aa  344  4e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
309 aa  344  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.61 
 
 
683 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
289 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.94 
 
 
326 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  33.43 
 
 
690 aa  341  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.21 
 
 
696 aa  341  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.74 
 
 
319 aa  341  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.75 
 
 
689 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.94 
 
 
309 aa  340  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.94 
 
 
309 aa  340  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.32 
 
 
694 aa  339  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.5 
 
 
298 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.14 
 
 
306 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.46 
 
 
689 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
292 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.45 
 
 
290 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.45 
 
 
294 aa  338  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.45 
 
 
290 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0539  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
305 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0639733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.48 
 
 
679 aa  337  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.63 
 
 
689 aa  337  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  53.5 
 
 
289 aa  337  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.98 
 
 
308 aa  337  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.33 
 
 
301 aa  337  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.84 
 
 
688 aa  337  7.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.17 
 
 
692 aa  336  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.39 
 
 
318 aa  336  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.42 
 
 
303 aa  336  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
290 aa  337  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>