More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29834 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4297  Glycine--tRNA ligase  47.08 
 
 
1024 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  45.45 
 
 
991 aa  811    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29834  predicted protein  100 
 
 
1051 aa  2150    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.93436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.59 
 
 
1019 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1275  glycine--tRNA ligase  46 
 
 
1017 aa  784    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.208463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.55 
 
 
993 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1038  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.79 
 
 
987 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0178  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits  33.6 
 
 
1003 aa  543  1e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.51 
 
 
296 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.24 
 
 
687 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.83 
 
 
698 aa  380  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.65 
 
 
297 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.14 
 
 
298 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
686 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.14 
 
 
321 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.95 
 
 
296 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.56 
 
 
294 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  35.48 
 
 
688 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.1 
 
 
291 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  58.1 
 
 
293 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.51 
 
 
289 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.43 
 
 
318 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.15 
 
 
364 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.33 
 
 
317 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.89 
 
 
290 aa  366  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.38 
 
 
301 aa  365  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.38 
 
 
301 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.38 
 
 
301 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.38 
 
 
301 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.38 
 
 
301 aa  365  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.54 
 
 
294 aa  365  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
301 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
327 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
301 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
301 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
301 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.06 
 
 
319 aa  364  6e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.06 
 
 
319 aa  364  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.63 
 
 
293 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.58 
 
 
315 aa  363  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.3 
 
 
291 aa  363  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
329 aa  363  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.39 
 
 
299 aa  363  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.93 
 
 
292 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000472181  hitchhiker  0.000000000290022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.63 
 
 
294 aa  363  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.38 
 
 
301 aa  363  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.74 
 
 
308 aa  362  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.05 
 
 
301 aa  362  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.75 
 
 
314 aa  361  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.56 
 
 
350 aa  362  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.23 
 
 
290 aa  362  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.23 
 
 
290 aa  362  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.25 
 
 
315 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.27 
 
 
315 aa  361  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.83 
 
 
696 aa  361  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.84 
 
 
292 aa  360  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.19 
 
 
292 aa  360  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.6 
 
 
296 aa  360  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.16 
 
 
689 aa  360  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.84 
 
 
291 aa  360  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.92 
 
 
689 aa  360  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
309 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.87 
 
 
290 aa  360  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.63 
 
 
290 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.38 
 
 
301 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  56.14 
 
 
289 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.34 
 
 
295 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.75 
 
 
306 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.14 
 
 
302 aa  359  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.38 
 
 
301 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.19 
 
 
291 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.09 
 
 
317 aa  358  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
315 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.19 
 
 
292 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.75 
 
 
292 aa  357  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16221  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.52 
 
 
290 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0239928  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.25 
 
 
315 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.52 
 
 
308 aa  357  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.25 
 
 
315 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.7 
 
 
318 aa  357  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.99 
 
 
694 aa  357  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.24 
 
 
678 aa  357  7.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.84 
 
 
291 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.14 
 
 
308 aa  357  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.25 
 
 
315 aa  357  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.63 
 
 
311 aa  356  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.49 
 
 
289 aa  357  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.88 
 
 
301 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.85 
 
 
301 aa  356  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.7 
 
 
335 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.44 
 
 
688 aa  356  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.33 
 
 
314 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.02 
 
 
325 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.14 
 
 
291 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.14 
 
 
719 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.82 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.09 
 
 
301 aa  355  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.82 
 
 
689 aa  354  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
689 aa  355  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.82 
 
 
689 aa  354  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>