More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4496 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  58.69 
 
 
991 aa  1092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.32 
 
 
1019 aa  1038    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1275  glycine--tRNA ligase  57.85 
 
 
1017 aa  1042    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.208463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
993 aa  1997    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29834  predicted protein  45.55 
 
 
1051 aa  805    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.93436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4297  Glycine--tRNA ligase  57.88 
 
 
1024 aa  1044    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1038  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  59.36 
 
 
987 aa  1088    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0178  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits  31.99 
 
 
1003 aa  509  1e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.98 
 
 
694 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.35 
 
 
695 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.63 
 
 
690 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.26 
 
 
698 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.75 
 
 
690 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.62 
 
 
686 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  36.93 
 
 
688 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.68 
 
 
687 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.34 
 
 
688 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.22 
 
 
711 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.61 
 
 
688 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.22 
 
 
711 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.06 
 
 
687 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.69 
 
 
292 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.34 
 
 
291 aa  364  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.04 
 
 
291 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.14 
 
 
717 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  36.36 
 
 
696 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
292 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
291 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.04 
 
 
292 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
719 aa  356  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
291 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
716 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.89 
 
 
687 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
290 aa  351  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.41 
 
 
690 aa  350  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
326 aa  350  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
293 aa  349  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
297 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
291 aa  349  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.21 
 
 
329 aa  348  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.79 
 
 
687 aa  348  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.85 
 
 
296 aa  348  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.11 
 
 
691 aa  347  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.9 
 
 
294 aa  347  8.999999999999999e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.83 
 
 
317 aa  346  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
309 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.86 
 
 
350 aa  346  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.94 
 
 
293 aa  345  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  34.92 
 
 
691 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
289 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.42 
 
 
299 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.9 
 
 
289 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.73 
 
 
691 aa  345  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.5 
 
 
294 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.55 
 
 
295 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.85 
 
 
301 aa  342  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  54.2 
 
 
289 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.55 
 
 
319 aa  342  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
688 aa  341  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.85 
 
 
308 aa  341  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.23 
 
 
686 aa  341  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.84 
 
 
688 aa  341  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
317 aa  340  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.33 
 
 
315 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.68 
 
 
327 aa  340  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
290 aa  340  9e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.2 
 
 
312 aa  340  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.5 
 
 
291 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.45 
 
 
309 aa  340  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.17 
 
 
314 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.45 
 
 
309 aa  340  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.15 
 
 
325 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.33 
 
 
315 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.8 
 
 
301 aa  338  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.53 
 
 
728 aa  338  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.5 
 
 
296 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.29 
 
 
298 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.48 
 
 
308 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.33 
 
 
315 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.91 
 
 
689 aa  338  3.9999999999999995e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.55 
 
 
321 aa  337  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.48 
 
 
306 aa  337  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.01 
 
 
687 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.59 
 
 
295 aa  336  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.39 
 
 
312 aa  336  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  52.78 
 
 
294 aa  337  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.39 
 
 
695 aa  336  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.63 
 
 
315 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.2 
 
 
318 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  51.75 
 
 
290 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.98 
 
 
301 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.63 
 
 
315 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  51.75 
 
 
290 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.26 
 
 
685 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.63 
 
 
315 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.63 
 
 
315 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  53.12 
 
 
296 aa  335  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  53.85 
 
 
290 aa  334  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.33 
 
 
364 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.2 
 
 
694 aa  334  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>