264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1092 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
293 aa  615  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  85.12 
 
 
289 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.66 
 
 
294 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.66 
 
 
292 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.79 
 
 
290 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.92 
 
 
309 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.31 
 
 
291 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.92 
 
 
309 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.92 
 
 
309 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.75 
 
 
295 aa  417  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.62 
 
 
291 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.24 
 
 
296 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.97 
 
 
292 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.15 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.21 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
291 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0268  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
304 aa  410  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.43665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0539  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.53 
 
 
305 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0639733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.24 
 
 
319 aa  407  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.44 
 
 
289 aa  407  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.01 
 
 
296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.46 
 
 
301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.74 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.28 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
293 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
294 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
295 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
292 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.14 
 
 
291 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.07 
 
 
300 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0740  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.76 
 
 
328 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.786171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.07 
 
 
312 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1194  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.85 
 
 
313 aa  391  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000563519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.32 
 
 
309 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.12 
 
 
287 aa  387  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
303 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1196  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
317 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0503079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.32 
 
 
327 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.46 
 
 
294 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.54 
 
 
287 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.1 
 
 
317 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.29 
 
 
321 aa  384  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.22 
 
 
285 aa  386  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
290 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0922  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.66 
 
 
292 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000402813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
287 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
329 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.35 
 
 
282 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
317 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
318 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
287 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 
325 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.76 
 
 
350 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.19 
 
 
319 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
289 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 
308 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
317 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
301 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.82 
 
 
319 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
292 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000472181  hitchhiker  0.000000000290022 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.82 
 
 
319 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
312 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 
301 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.01 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.89 
 
 
296 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
318 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.36 
 
 
301 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.92 
 
 
298 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
315 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
290 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
364 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
314 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
315 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
315 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1588  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
282 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.19 
 
 
290 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
301 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.38 
 
 
312 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.36 
 
 
314 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3371  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.55 
 
 
333 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00416718  normal  0.205184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.2 
 
 
308 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0732  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
286 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
315 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.97 
 
 
286 aa  374  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
290 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
290 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
294 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
301 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>