264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0708 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
301 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.19 
 
 
285 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.19 
 
 
287 aa  502  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.68 
 
 
286 aa  503  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.42 
 
 
287 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.77 
 
 
287 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.42 
 
 
287 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.05 
 
 
286 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1655  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  74.91 
 
 
285 aa  472  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000011952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.28 
 
 
293 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.123358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.71 
 
 
306 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.32 
 
 
301 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.61 
 
 
310 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.09 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.58 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  394  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.52 
 
 
301 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.19 
 
 
309 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.89 
 
 
314 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
312 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.08 
 
 
318 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.42 
 
 
312 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.3 
 
 
317 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
312 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
312 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
317 aa  391  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.01 
 
 
308 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
301 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.3 
 
 
317 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.56 
 
 
314 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.18 
 
 
287 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
329 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.19 
 
 
317 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.42 
 
 
314 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.69 
 
 
318 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
319 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.9 
 
 
303 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.22 
 
 
322 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.74 
 
 
324 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
320 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
323 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.5 
 
 
350 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0713  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.54 
 
 
318 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
287 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.03 
 
 
315 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
312 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.85 
 
 
302 aa  387  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.69 
 
 
364 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
308 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.69 
 
 
315 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.71 
 
 
315 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 
335 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.36 
 
 
327 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.69 
 
 
310 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.05 
 
 
290 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.16 
 
 
301 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
315 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.5 
 
 
325 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.51 
 
 
301 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
287 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.69 
 
 
315 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.5 
 
 
308 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.84 
 
 
314 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.63 
 
 
314 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
323 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
296 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0509  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.05 
 
 
322 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00315441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.28 
 
 
304 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0529  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
311 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.919746  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.5 
 
 
308 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.03 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.16 
 
 
290 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.98 
 
 
318 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0448  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.07 
 
 
317 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
317 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.2 
 
 
320 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2758  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
313 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.56 
 
 
291 aa  381  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.93 
 
 
303 aa  381  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.28 
 
 
335 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0406  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
335 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.995928  normal  0.36561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61 
 
 
314 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1979  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
319 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.435226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>