265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0804 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  99.3 
 
 
287 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  98.26 
 
 
287 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.82 
 
 
286 aa  548  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.42 
 
 
301 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.3 
 
 
286 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.95 
 
 
287 aa  488  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.89 
 
 
285 aa  483  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1655  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.8 
 
 
285 aa  463  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000011952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.14 
 
 
293 aa  437  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.123358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.47 
 
 
301 aa  391  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.23 
 
 
291 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.31 
 
 
290 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.23 
 
 
292 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.11 
 
 
301 aa  387  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.06 
 
 
292 aa  384  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.31 
 
 
309 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 
301 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.41 
 
 
291 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.23 
 
 
296 aa  384  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
310 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
317 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
306 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.23 
 
 
291 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
301 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.03 
 
 
302 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
317 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.06 
 
 
291 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.08 
 
 
314 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.83 
 
 
293 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.94 
 
 
323 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.48 
 
 
304 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.31 
 
 
308 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
322 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.41 
 
 
292 aa  381  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
311 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
308 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.16 
 
 
308 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0412  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
316 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.32208  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
329 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.95 
 
 
314 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
304 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.96 
 
 
350 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 
317 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
301 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.23 
 
 
364 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
308 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.65 
 
 
290 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.23 
 
 
318 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.44 
 
 
312 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0573  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.11 
 
 
311 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
304 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 
303 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0693  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.07 
 
 
304 aa  375  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.11795  hitchhiker  0.0000246007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 
304 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.76 
 
 
314 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.93 
 
 
301 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
325 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.65 
 
 
318 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.06 
 
 
312 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.44 
 
 
301 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
303 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
310 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0521  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.45 
 
 
311 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
320 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.71 
 
 
304 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 
309 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.8 
 
 
314 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
316 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.04 
 
 
287 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0529  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.84 
 
 
311 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.919746  normal  0.728167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 
303 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.21 
 
 
317 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.19 
 
 
318 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.17 
 
 
320 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.93 
 
 
304 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.29 
 
 
289 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>