264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0992 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
319 aa  664    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1194  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.32 
 
 
313 aa  550  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000563519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1196  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.25 
 
 
317 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0740  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.73 
 
 
328 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.786171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0268  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.37 
 
 
304 aa  474  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.43665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0539  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.37 
 
 
305 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0639733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1116  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.81 
 
 
305 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
290 aa  394  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.9 
 
 
309 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
309 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
309 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.22 
 
 
326 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.19 
 
 
289 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.17 
 
 
291 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.17 
 
 
292 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.17 
 
 
291 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.11 
 
 
319 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.76 
 
 
294 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.88 
 
 
296 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.76 
 
 
289 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
315 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
315 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.76 
 
 
291 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.46 
 
 
291 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 
318 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.19 
 
 
293 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
296 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.27 
 
 
300 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.45 
 
 
291 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.11 
 
 
292 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
315 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
292 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.98 
 
 
301 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.53 
 
 
317 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
308 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.88 
 
 
329 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
327 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.72 
 
 
292 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.88 
 
 
314 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
312 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.03 
 
 
294 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.19 
 
 
325 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.26 
 
 
318 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.27 
 
 
350 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.38 
 
 
297 aa  378  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.9 
 
 
321 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
315 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.7 
 
 
312 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.89 
 
 
317 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.64 
 
 
318 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.72 
 
 
295 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.84 
 
 
301 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.96 
 
 
303 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.38 
 
 
296 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
308 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.54 
 
 
309 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.25 
 
 
335 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.15 
 
 
304 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.94 
 
 
308 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 
317 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.79 
 
 
317 aa  371  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
301 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.93 
 
 
290 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 
314 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.79 
 
 
317 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.47 
 
 
303 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.48 
 
 
306 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.68 
 
 
289 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
304 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
304 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.27 
 
 
312 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.09 
 
 
301 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.47 
 
 
303 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
323 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
304 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
304 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.3 
 
 
304 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
309 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.29 
 
 
293 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.47 
 
 
303 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
304 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.96 
 
 
304 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.47 
 
 
303 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.43 
 
 
301 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.26 
 
 
364 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.81 
 
 
303 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>