264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3371 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3371  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
333 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00416718  normal  0.205184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.66 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.9 
 
 
291 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
291 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
291 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.86 
 
 
292 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.28 
 
 
321 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
292 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
317 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
292 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.51 
 
 
291 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.88 
 
 
329 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.75 
 
 
315 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.2 
 
 
289 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.69 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.4 
 
 
315 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.44 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.95 
 
 
319 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.07 
 
 
296 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.91 
 
 
350 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.99 
 
 
308 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.65 
 
 
301 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.6 
 
 
290 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.71 
 
 
315 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.36 
 
 
315 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  67.36 
 
 
315 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
335 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.71 
 
 
315 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.93 
 
 
317 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.44 
 
 
309 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
318 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.44 
 
 
326 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.36 
 
 
315 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
318 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
291 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.36 
 
 
315 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.78 
 
 
308 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.4 
 
 
300 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.45 
 
 
291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.51 
 
 
295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.33 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.87 
 
 
309 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.93 
 
 
311 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.85 
 
 
290 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.41 
 
 
294 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.31 
 
 
308 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
319 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.36 
 
 
289 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
319 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.1 
 
 
309 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.1 
 
 
309 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.54 
 
 
301 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.31 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.4 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.99 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.58 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03831  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.52 
 
 
302 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.99 
 
 
312 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.94 
 
 
318 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.17 
 
 
301 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.02 
 
 
296 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.14 
 
 
307 aa  391  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0761934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.2 
 
 
327 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.79 
 
 
314 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.94 
 
 
301 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0888  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.14 
 
 
307 aa  391  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.93 
 
 
292 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.83 
 
 
301 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
294 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.84 
 
 
304 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.48 
 
 
301 aa  391  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.83 
 
 
301 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.64 
 
 
308 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
301 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1805  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
301 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.32 
 
 
289 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.1 
 
 
309 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.45 
 
 
301 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
287 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
325 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.54 
 
 
317 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.59 
 
 
301 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.98 
 
 
323 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.76 
 
 
317 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
303 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.16 
 
 
304 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
287 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.54 
 
 
317 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.1 
 
 
303 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.33 
 
 
335 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.67 
 
 
335 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0984004  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0717  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.33 
 
 
335 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>