264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1047 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
285 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.51 
 
 
287 aa  508  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.19 
 
 
301 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  81.75 
 
 
286 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.25 
 
 
287 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1655  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  78.65 
 
 
285 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000011952  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.89 
 
 
287 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.89 
 
 
287 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.49 
 
 
286 aa  473  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.5 
 
 
293 aa  433  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.123358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.83 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
290 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.26 
 
 
319 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
308 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.56 
 
 
317 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.51 
 
 
329 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.52 
 
 
296 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.08 
 
 
291 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.61 
 
 
291 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.91 
 
 
318 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.31 
 
 
323 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.16 
 
 
350 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.95 
 
 
306 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.96 
 
 
296 aa  391  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.91 
 
 
295 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.97 
 
 
310 aa  391  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.79 
 
 
364 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.38 
 
 
292 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.39 
 
 
308 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
322 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.61 
 
 
291 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.26 
 
 
292 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.51 
 
 
289 aa  384  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
310 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.23 
 
 
291 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 
314 aa  384  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
312 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
312 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.08 
 
 
301 aa  384  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0713  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.2 
 
 
318 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.22 
 
 
293 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.46 
 
 
290 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.68 
 
 
315 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
318 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.12 
 
 
314 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
292 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.25 
 
 
317 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
312 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.44 
 
 
292 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.06 
 
 
301 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
301 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.12 
 
 
315 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.66 
 
 
301 aa  380  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.86 
 
 
320 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.67 
 
 
302 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.16 
 
 
289 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.51 
 
 
308 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.25 
 
 
317 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
323 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0573  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.48 
 
 
311 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.99 
 
 
315 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
315 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 
317 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
312 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.21 
 
 
308 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.48 
 
 
304 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.6 
 
 
295 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.46 
 
 
314 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.68 
 
 
312 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.81 
 
 
301 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
320 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1979  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.35 
 
 
319 aa  377  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.37 
 
 
304 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.25 
 
 
303 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.81 
 
 
294 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
317 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
294 aa  377  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
315 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.36 
 
 
301 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.11 
 
 
308 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.96 
 
 
301 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.09 
 
 
314 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.41 
 
 
324 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.35 
 
 
328 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
318 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 
314 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.02 
 
 
303 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.89 
 
 
303 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>