264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1002 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 		 286 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.53 
 
 		 287 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.82 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.82 
 
 		 287 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1439  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.7 
 
 		 286 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0284  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.37 
 
 		 287 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000951554  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.05 
 
 		 301 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.49 
 
 		 285 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1655  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  77.58 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000011952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.93 
 
 		 293 aa  447  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.123358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 		 301 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.77 
 
 		 314 aa  377  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.93 
 
 		 301 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.89 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 		 306 aa  377  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.75 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.75 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.93 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.92 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.84 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.31 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.23 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.08 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.56 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0403  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.7 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.9 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0412  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.7 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.32208  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.44 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 		 314 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0693  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.11795  hitchhiker  0.0000246007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.87 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.08 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.01 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.04 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.18 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.44 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.66 
 
 		 324 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.57 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.64 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.29 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.05 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.67 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.41 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.41 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.35 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.67 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0984004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0448  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.01 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.67 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>