More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1038 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4297  Glycine--tRNA ligase  67.33 
 
 
1024 aa  1264    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83812  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29834  predicted protein  47.38 
 
 
1051 aa  856    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.93436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1275  glycine--tRNA ligase  65.02 
 
 
1017 aa  1190    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.208463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  59.36 
 
 
993 aa  1115    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1038  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
987 aa  1957    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.46 
 
 
1019 aa  1184    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  63.2 
 
 
991 aa  1188    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0178  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits  36.36 
 
 
1003 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  37.19 
 
 
695 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.43 
 
 
698 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  36.48 
 
 
688 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.91 
 
 
690 aa  392  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.85 
 
 
691 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  39.89 
 
 
693 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
297 aa  382  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.32 
 
 
687 aa  376  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.01 
 
 
293 aa  376  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.77 
 
 
690 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.07 
 
 
696 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
291 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.66 
 
 
687 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.36 
 
 
294 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.57 
 
 
686 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.36 
 
 
291 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.36 
 
 
292 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
290 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.3 
 
 
296 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.01 
 
 
691 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.2 
 
 
694 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.01 
 
 
291 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
292 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.6 
 
 
294 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.66 
 
 
291 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.5 
 
 
687 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
291 aa  365  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.51 
 
 
292 aa  365  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.8 
 
 
289 aa  363  8e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  56.89 
 
 
289 aa  363  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.42 
 
 
705 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.04 
 
 
289 aa  362  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.61 
 
 
696 aa  362  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.8 
 
 
309 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.12 
 
 
696 aa  362  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.45 
 
 
290 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.08 
 
 
690 aa  360  7e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.87 
 
 
687 aa  360  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.51 
 
 
295 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.61 
 
 
693 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  37.7 
 
 
688 aa  360  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.75 
 
 
292 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.8 
 
 
309 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.8 
 
 
309 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.1 
 
 
296 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.39 
 
 
321 aa  358  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.8 
 
 
326 aa  358  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.95 
 
 
299 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.04 
 
 
291 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
719 aa  357  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.1 
 
 
319 aa  356  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  35.91 
 
 
696 aa  356  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.45 
 
 
300 aa  355  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.54 
 
 
293 aa  355  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  35.86 
 
 
691 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37 
 
 
686 aa  354  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.55 
 
 
693 aa  354  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  37.34 
 
 
700 aa  353  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.54 
 
 
295 aa  353  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
688 aa  353  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.42 
 
 
290 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.42 
 
 
290 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.96 
 
 
687 aa  351  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.52 
 
 
689 aa  351  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.86 
 
 
298 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.45 
 
 
294 aa  351  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.94 
 
 
317 aa  351  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.29 
 
 
296 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.66 
 
 
689 aa  350  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.51 
 
 
315 aa  350  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.16 
 
 
315 aa  350  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.16 
 
 
315 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.6 
 
 
329 aa  349  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.51 
 
 
315 aa  350  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.99 
 
 
290 aa  350  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.16 
 
 
315 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.72 
 
 
693 aa  349  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  56.03 
 
 
290 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.16 
 
 
315 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.24 
 
 
317 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.51 
 
 
315 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.64 
 
 
306 aa  349  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0539  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.34 
 
 
305 aa  349  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0639733  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  37.34 
 
 
694 aa  348  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  56.69 
 
 
301 aa  348  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.94 
 
 
318 aa  348  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.6 
 
 
314 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.39 
 
 
689 aa  347  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.25 
 
 
350 aa  347  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0268  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.63 
 
 
304 aa  347  8.999999999999999e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.43665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.86 
 
 
308 aa  346  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.29 
 
 
711 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>