More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4412 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4412  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
384 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2396  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 
355 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
674 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
636 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  31.35 
 
 
584 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
457 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 
567 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 
567 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
656 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.51 
 
 
567 aa  152  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 
666 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
584 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
585 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
741 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
665 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
665 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 
666 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 
586 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  28.88 
 
 
649 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 
688 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.68 
 
 
671 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 
649 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.52 
 
 
582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 
664 aa  136  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.89 
 
 
543 aa  135  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
585 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
586 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  27.72 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.97 
 
 
670 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.35 
 
 
682 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.84 
 
 
589 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
672 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  27.12 
 
 
589 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.38 
 
 
585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  26.78 
 
 
589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 
697 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 
676 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  27.63 
 
 
568 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  26.84 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  28.18 
 
 
649 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 
666 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  28.42 
 
 
650 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.93 
 
 
572 aa  129  9.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.31 
 
 
539 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
654 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
586 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 
586 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  27.47 
 
 
569 aa  126  6e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
668 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  27.12 
 
 
589 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  26.78 
 
 
533 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
589 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.76 
 
 
587 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.79 
 
 
585 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.35 
 
 
648 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
741 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.79 
 
 
585 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.6 
 
 
720 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.22 
 
 
587 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.8 
 
 
662 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
693 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
587 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  29.81 
 
 
648 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  29.81 
 
 
648 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 
653 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
388 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
664 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
589 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  26.54 
 
 
628 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.23 
 
 
663 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 
672 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  25.93 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.76 
 
 
655 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.17 
 
 
648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  27.17 
 
 
648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.17 
 
 
648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 
710 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  26.16 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  29.1 
 
 
648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2079  Sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 
539 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
661 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  26.08 
 
 
621 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  25.94 
 
 
628 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
666 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.26 
 
 
605 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
661 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.01 
 
 
541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.01 
 
 
541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  27.54 
 
 
649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  26.65 
 
 
661 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0776  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 
541 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 
541 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 
656 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  27.27 
 
 
624 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.09 
 
 
648 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 
671 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>