More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2119 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  98.64 
 
 		 442 aa  853    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  98.64 
 
 		 442 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  98.42 
 
 		 442 aa  853    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  89.8 
 
 		 442 aa  783    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  79.21 
 
 		 439 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  98.19 
 
 		 442 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  100 
 
 		 442 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  98.64 
 
 		 442 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  98.64 
 
 		 442 aa  853    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  98.19 
 
 		 442 aa  852    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  72.2 
 
 		 553 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  70.79 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  71.03 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  68.68 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  70.09 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  71.16 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  69.27 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  68.57 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  67.37 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  70.44 
 
 		 435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  70.09 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  69.98 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  67.37 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  70.45 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  69.74 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  69.27 
 
 		 435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  69.27 
 
 		 435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  69.27 
 
 		 435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  70.21 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  68.46 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  68.7 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  65.17 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  62.68 
 
 		 459 aa  529  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  64.45 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  63.59 
 
 		 477 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  63.12 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  60.61 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  58.33 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  58.49 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  59.76 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  58.1 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  58.35 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  44.39 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  46.77 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  47.18 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  48.64 
 
 		 441 aa  316  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  43.88 
 
 		 468 aa  316  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  43.69 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  43.16 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  47.31 
 
 		 450 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  48.23 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  43.02 
 
 		 469 aa  305  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  43.83 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  47.41 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.82 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  48.62 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  48.79 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 		 487 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  41.06 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  43.27 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  44.15 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  42.44 
 
 		 473 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  39.52 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  48.03 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  40.71 
 
 		 463 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  39.59 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  41.07 
 
 		 487 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  40.77 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  42.09 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  40.77 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  40.53 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  39.09 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  39.09 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  39.11 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  41.55 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  42.24 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.04 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  37.44 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  37.99 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  37.99 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  37.99 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  37.53 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  39.46 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  39.46 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.23 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  37.13 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  39.56 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  39.22 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  39.46 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  39.46 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  38.76 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>