More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1488 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 487 aa  956    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  64.3 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.41 
 
 		 492 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  61.37 
 
 		 455 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  62.36 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  63.74 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  57.53 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  60.75 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  44.69 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  44.3 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  45.18 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  45.18 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  45.18 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  42.15 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  41.06 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  42.62 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  41.79 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  42.07 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  45.37 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  41.7 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  43.32 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  44.71 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  44.09 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  42.35 
 
 		 432 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  44.4 
 
 		 450 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  40.39 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  40.13 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  39.91 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  40.13 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  40.13 
 
 		 442 aa  299  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  39.91 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  39.91 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  38.97 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  39.91 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  39.91 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  39.91 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  42.15 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  43.53 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  40.41 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  42.73 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  41.36 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  44.61 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  40.49 
 
 		 459 aa  290  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  44.72 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  41.51 
 
 		 482 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  40.19 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  40.91 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  39.19 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  40.24 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  40.48 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  40.09 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  38.83 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  39.77 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  41.83 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  40.19 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  41.39 
 
 		 428 aa  276  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  39.17 
 
 		 428 aa  276  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  40.6 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  40.27 
 
 		 477 aa  273  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  38.8 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  38.8 
 
 		 426 aa  251  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  37.33 
 
 		 429 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  38.79 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  38.41 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.24 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  38.2 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  33.26 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  33.19 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  33.72 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  33.72 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  33.72 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  33.72 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  31.21 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  33.94 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  30.77 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  30.77 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  35.66 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  33.11 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  31.63 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  31.63 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  31.96 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  31.38 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  31.67 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  31.67 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  31.45 
 
 		 429 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>