More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  100 
 
 
441 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  63.45 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  69.54 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  67.63 
 
 
472 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  60.59 
 
 
433 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  68.75 
 
 
436 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  65.77 
 
 
454 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  69.86 
 
 
450 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  62.9 
 
 
463 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  63.89 
 
 
414 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  63.26 
 
 
433 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  62.03 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  62.03 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  62.03 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  66.82 
 
 
425 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  58.33 
 
 
429 aa  464  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  61.77 
 
 
445 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  59.76 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  51.28 
 
 
490 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  47.36 
 
 
455 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.72 
 
 
492 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  50.23 
 
 
433 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  50 
 
 
428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  47.65 
 
 
435 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  48.54 
 
 
428 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  48.87 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  48.87 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  48.64 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  48.87 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  48.53 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  48.87 
 
 
442 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  48.87 
 
 
442 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  48.87 
 
 
442 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  48.64 
 
 
442 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  48.22 
 
 
439 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  48.1 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  48.41 
 
 
442 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  49.88 
 
 
553 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  48.59 
 
 
435 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  49.51 
 
 
435 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.29 
 
 
487 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  49.26 
 
 
435 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  50.13 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  48.41 
 
 
428 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  49.87 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  49.01 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  49.01 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  48.81 
 
 
482 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  49.01 
 
 
434 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  44.7 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  48.27 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  45.91 
 
 
487 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  50.37 
 
 
435 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  50.37 
 
 
435 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  50.37 
 
 
435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  50.37 
 
 
435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  50.37 
 
 
435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  50.37 
 
 
435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  50.12 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  49.01 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  45.48 
 
 
468 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  49.76 
 
 
431 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  49.14 
 
 
428 aa  333  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.47 
 
 
415 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  44.98 
 
 
457 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  45.67 
 
 
443 aa  329  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  48.58 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  48.65 
 
 
428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  47.86 
 
 
429 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  46.43 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  46.19 
 
 
426 aa  312  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  44.44 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  47.32 
 
 
483 aa  309  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  49.17 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  44 
 
 
477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  44.83 
 
 
477 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  42.45 
 
 
429 aa  279  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  43.4 
 
 
433 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.63 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  39 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  38.75 
 
 
432 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  41.62 
 
 
429 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  40.54 
 
 
429 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  42.28 
 
 
429 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  39.29 
 
 
428 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  39.29 
 
 
428 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  38.92 
 
 
429 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  39.35 
 
 
423 aa  260  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  38.92 
 
 
429 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  40.35 
 
 
429 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  38.68 
 
 
429 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  36.95 
 
 
457 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  40.25 
 
 
429 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  40.25 
 
 
429 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  40.1 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  40.1 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  40.1 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  40.1 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  40.1 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  40.99 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>