More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0128 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  91.78 
 
 
450 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  100 
 
 
472 aa  918    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  63.15 
 
 
469 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  71 
 
 
450 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  65.76 
 
 
463 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  69.95 
 
 
436 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  67.63 
 
 
441 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  62.31 
 
 
433 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  62.58 
 
 
454 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  60.95 
 
 
414 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  58.84 
 
 
433 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  66.04 
 
 
425 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  58.84 
 
 
433 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  58.84 
 
 
433 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  61.52 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  59 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  56.74 
 
 
429 aa  449  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  58.53 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  47.61 
 
 
435 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  48.85 
 
 
490 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  47.61 
 
 
553 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  46.48 
 
 
428 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  48.23 
 
 
435 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  47.03 
 
 
455 aa  352  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  47.07 
 
 
428 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.13 
 
 
492 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  47.14 
 
 
435 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  47.49 
 
 
435 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  47.74 
 
 
435 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  49.14 
 
 
428 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  49.17 
 
 
433 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  47.47 
 
 
435 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  47.73 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  47.73 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  47.73 
 
 
435 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  47.64 
 
 
442 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  47.64 
 
 
442 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  47.64 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  47.41 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  47.64 
 
 
442 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  47.47 
 
 
434 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  47.64 
 
 
442 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.18 
 
 
415 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  47.64 
 
 
442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  47.41 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  46.3 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  45.8 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  46.17 
 
 
435 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  47.56 
 
 
428 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  47.22 
 
 
434 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  47.49 
 
 
482 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.41 
 
 
487 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  46.65 
 
 
443 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  47.36 
 
 
428 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  46.19 
 
 
429 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  44.74 
 
 
473 aa  322  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  45.39 
 
 
487 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  47.12 
 
 
428 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  45.82 
 
 
426 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  42.79 
 
 
468 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  45.82 
 
 
426 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  47.56 
 
 
483 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  44 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  44.17 
 
 
459 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  42.99 
 
 
431 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  44.5 
 
 
477 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  42.42 
 
 
434 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  45.24 
 
 
477 aa  292  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  45.19 
 
 
453 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  41.16 
 
 
429 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  42.2 
 
 
433 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  39 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  39.9 
 
 
429 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  40.82 
 
 
429 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  37.96 
 
 
432 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  37.71 
 
 
432 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  40.99 
 
 
415 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  40.69 
 
 
428 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  40.69 
 
 
428 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  37.86 
 
 
422 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  37.97 
 
 
435 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  37.97 
 
 
435 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  39.67 
 
 
429 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  39.81 
 
 
429 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>