More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2636 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  99.1 
 
 
442 aa  856    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  99.1 
 
 
442 aa  856    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  100 
 
 
442 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  99.32 
 
 
442 aa  859    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  79.44 
 
 
439 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  99.55 
 
 
442 aa  857    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  99.1 
 
 
442 aa  856    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  99.55 
 
 
442 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  98.64 
 
 
442 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  90.48 
 
 
442 aa  787    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  72.43 
 
 
553 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  69.14 
 
 
435 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  70.79 
 
 
435 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  71.03 
 
 
435 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  71.03 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  71.26 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  71.03 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  71.03 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  71.03 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  71.03 
 
 
435 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  69.98 
 
 
428 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  68.65 
 
 
428 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  71.39 
 
 
435 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  70.9 
 
 
435 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  67.84 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  70.56 
 
 
435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  67.84 
 
 
428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  70.69 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  70.21 
 
 
435 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  69.98 
 
 
433 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  69.5 
 
 
435 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  69.5 
 
 
435 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  69.5 
 
 
435 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  70.45 
 
 
434 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  68.7 
 
 
428 aa  541  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  68.95 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  65.4 
 
 
432 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  62.44 
 
 
459 aa  529  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  64.69 
 
 
482 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  63.36 
 
 
477 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  62.65 
 
 
477 aa  502  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  61.08 
 
 
434 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  58.81 
 
 
426 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  59.11 
 
 
429 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  58.96 
 
 
431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  58.57 
 
 
426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  58.81 
 
 
483 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  45.54 
 
 
433 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  44.63 
 
 
490 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  47.49 
 
 
453 aa  319  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  47.4 
 
 
445 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  46.3 
 
 
433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  46.3 
 
 
433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  46.3 
 
 
433 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  48.87 
 
 
441 aa  317  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  44.05 
 
 
468 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  43.93 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  43.63 
 
 
455 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  47.54 
 
 
450 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  48.46 
 
 
425 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  43.24 
 
 
469 aa  305  7e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  44.07 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  47.64 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.06 
 
 
492 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  48.62 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  48.33 
 
 
454 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 
487 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  41.3 
 
 
429 aa  294  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  43.5 
 
 
457 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  43.97 
 
 
433 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  42.68 
 
 
473 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  48.28 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  39.52 
 
 
415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  40.84 
 
 
463 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  39.91 
 
 
457 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  41.3 
 
 
487 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  42.34 
 
 
429 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  40.33 
 
 
432 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  40.33 
 
 
432 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  39.33 
 
 
432 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  39.33 
 
 
432 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  39.47 
 
 
422 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  40.29 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  41.31 
 
 
434 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  42.24 
 
 
409 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.27 
 
 
415 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  37.67 
 
 
423 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.27 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  37.99 
 
 
438 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.23 
 
 
429 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  37.99 
 
 
438 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  37.99 
 
 
438 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  40.98 
 
 
433 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  39.46 
 
 
427 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  39.46 
 
 
427 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  38.73 
 
 
427 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  39.46 
 
 
427 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  39.46 
 
 
427 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  37.77 
 
 
433 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  39.22 
 
 
427 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>