More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1374 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  100 
 
 
453 aa  874    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  49.78 
 
 
435 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  48.84 
 
 
432 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  49.1 
 
 
428 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  48.57 
 
 
553 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  47.53 
 
 
442 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  48.85 
 
 
428 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  53.46 
 
 
482 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  52 
 
 
435 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  47.29 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  47.29 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  48.17 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  46.65 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  46.92 
 
 
439 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  46.91 
 
 
435 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  47.9 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  47.9 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  51.2 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  47.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  47.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  47.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  47.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  47.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  47.06 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  47.29 
 
 
442 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  46.83 
 
 
442 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  47.06 
 
 
442 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  46.61 
 
 
442 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  46.64 
 
 
426 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  50.79 
 
 
435 aa  347  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 
426 aa  346  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  46.05 
 
 
429 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  49.66 
 
 
433 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  49.74 
 
 
435 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  50.79 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  50.79 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  50.79 
 
 
435 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  47 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  46.44 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  45.37 
 
 
483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  46.01 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  49.74 
 
 
434 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  48.62 
 
 
428 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  48.62 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  49.74 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  43.02 
 
 
427 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  43.64 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  43.64 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  43.64 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  43.64 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  43.64 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  43.64 
 
 
427 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  43.64 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  43.64 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  43.48 
 
 
427 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  42.44 
 
 
430 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  43.12 
 
 
459 aa  316  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.37 
 
 
432 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  43.84 
 
 
434 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  43.12 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  42.69 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  43.35 
 
 
415 aa  303  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  43.58 
 
 
432 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  43.58 
 
 
432 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 
432 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  43.92 
 
 
429 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  44.85 
 
 
433 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  43.65 
 
 
422 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  45.09 
 
 
433 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  40.84 
 
 
430 aa  289  6e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  39.55 
 
 
428 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  39.55 
 
 
428 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  45.95 
 
 
412 aa  289  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  41.39 
 
 
429 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  40.23 
 
 
435 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  40.23 
 
 
435 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  43.08 
 
 
434 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  42.29 
 
 
409 aa  286  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  47.63 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  38.41 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.32 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  44.96 
 
 
414 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  40.22 
 
 
429 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  49.17 
 
 
441 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  42.47 
 
 
399 aa  279  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  42.47 
 
 
399 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  39.2 
 
 
432 aa  279  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  44.88 
 
 
433 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  44.88 
 
 
433 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  44.88 
 
 
433 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  41.78 
 
 
403 aa  278  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  39.2 
 
 
432 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 
469 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  40.87 
 
 
429 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  40.87 
 
 
429 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  39.37 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  41.84 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  39.37 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  39.37 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  39.37 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>