More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3008 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  94.48 
 
 
435 aa  777    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  94.94 
 
 
434 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  86.67 
 
 
435 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  86.67 
 
 
435 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  86.9 
 
 
435 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  86.67 
 
 
435 aa  737    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  86.41 
 
 
435 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  93.56 
 
 
435 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  86.67 
 
 
435 aa  737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  88.51 
 
 
553 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  86.87 
 
 
435 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  86.67 
 
 
435 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  94.25 
 
 
435 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  84.6 
 
 
435 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  100 
 
 
435 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  94.94 
 
 
434 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  86.67 
 
 
435 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  94.25 
 
 
435 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  72.73 
 
 
439 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  72.09 
 
 
428 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  72.64 
 
 
428 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  71.39 
 
 
442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  71.16 
 
 
442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  71.16 
 
 
442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  70.92 
 
 
442 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  71.16 
 
 
442 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  70.92 
 
 
442 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  70.92 
 
 
442 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  70.92 
 
 
442 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  70.69 
 
 
428 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  69.3 
 
 
435 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  71.96 
 
 
433 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  69.5 
 
 
442 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  70.99 
 
 
428 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  70.73 
 
 
428 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  70 
 
 
428 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  65.81 
 
 
432 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  65.81 
 
 
482 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  63.12 
 
 
434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  62.12 
 
 
459 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  61.21 
 
 
429 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  61.59 
 
 
431 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  61.74 
 
 
477 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  61.03 
 
 
477 aa  488  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  57.96 
 
 
426 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  59.48 
 
 
483 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  57.72 
 
 
426 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 
433 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  44.87 
 
 
414 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  44.24 
 
 
469 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  43.55 
 
 
433 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  47.65 
 
 
453 aa  328  9e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  43.55 
 
 
433 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  43.55 
 
 
433 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  45.63 
 
 
450 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  47.29 
 
 
433 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  45.8 
 
 
445 aa  322  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  47.13 
 
 
472 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  48.05 
 
 
450 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  48.11 
 
 
425 aa  319  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  48.15 
 
 
441 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  43.55 
 
 
490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  46.57 
 
 
436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  47.54 
 
 
454 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  41.38 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  43.59 
 
 
443 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  42.23 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  41.33 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.81 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  44.31 
 
 
429 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  43.24 
 
 
468 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  42.06 
 
 
487 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  43.14 
 
 
415 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.82 
 
 
487 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  42.33 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  40.27 
 
 
473 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  39.29 
 
 
422 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  39.72 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  39.72 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  39.72 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.94 
 
 
415 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  39.29 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  37.26 
 
 
432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  37.26 
 
 
432 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  41.75 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  38.85 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  42.17 
 
 
409 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.32 
 
 
429 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  41.56 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  41.56 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  37.38 
 
 
429 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  40.66 
 
 
434 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  37.12 
 
 
428 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  37.12 
 
 
428 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  37.73 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  36.62 
 
 
433 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  37.7 
 
 
429 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  39.7 
 
 
403 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  37.7 
 
 
429 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  37.47 
 
 
429 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>