More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2231 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  100 
 
 
455 aa  890    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.61 
 
 
492 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  77.58 
 
 
473 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  68.01 
 
 
490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  62.5 
 
 
468 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  66.28 
 
 
443 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  64.21 
 
 
487 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.74 
 
 
487 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  60.22 
 
 
457 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  48.41 
 
 
433 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  45.72 
 
 
469 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  47.38 
 
 
429 aa  359  7e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  49.53 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  49.53 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  49.53 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  48.93 
 
 
414 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  47.76 
 
 
441 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  47.96 
 
 
429 aa  349  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  47.84 
 
 
425 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  45.67 
 
 
435 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  46.07 
 
 
463 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  47.17 
 
 
450 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  47.84 
 
 
454 aa  342  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  47.67 
 
 
450 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  45.41 
 
 
428 aa  339  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  45.09 
 
 
445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  48.41 
 
 
436 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  47.03 
 
 
472 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  44 
 
 
428 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  44.53 
 
 
428 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  44.09 
 
 
433 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  42.19 
 
 
433 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  43.63 
 
 
442 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  43.63 
 
 
442 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  43.55 
 
 
439 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  41.01 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  43.63 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  44.74 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  43.63 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  43.16 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  43.63 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  43.4 
 
 
442 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  41.61 
 
 
553 aa  320  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 
434 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  41.97 
 
 
435 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 
435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  42.93 
 
 
435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  42.93 
 
 
435 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  42.45 
 
 
435 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  46.12 
 
 
428 aa  315  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  41.98 
 
 
435 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  42.53 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  41.98 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  46.12 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  41.73 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  42.21 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  41.88 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  41.61 
 
 
435 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  39.86 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 
434 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  42.25 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  39.43 
 
 
459 aa  282  9e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  39.41 
 
 
477 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  40.67 
 
 
477 aa  280  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.76 
 
 
415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  40.23 
 
 
431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  40.09 
 
 
429 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  39.62 
 
 
426 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  39.62 
 
 
426 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  41.24 
 
 
453 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  35.65 
 
 
457 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  37.05 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  36.19 
 
 
429 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  32.64 
 
 
438 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  32.64 
 
 
438 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  32.64 
 
 
438 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  33.97 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  34.99 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  33.49 
 
 
427 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  34.99 
 
 
429 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  35.9 
 
 
428 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 
430 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  35.9 
 
 
428 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  34.52 
 
 
422 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  35.15 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  35.15 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  34.65 
 
 
433 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  34.06 
 
 
423 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  35.92 
 
 
429 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>