More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 436 aa  845    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  69.48 
 
 		 469 aa  611  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  74.49 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  67.91 
 
 		 463 aa  551  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  72.91 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  70.43 
 
 		 450 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  68.85 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  72.54 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  68.33 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  62.53 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  64.68 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  63.94 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  62.96 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  62.96 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  62.96 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  62.98 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  60.47 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  62.17 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  48.12 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  48.03 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  48.28 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  47.35 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  46.93 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  47.92 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  48.07 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  46.57 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  47.13 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  47.35 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  46.68 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  48.1 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  46.81 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  46.34 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  46.34 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  46.34 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  46.72 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  46.39 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  45.14 
 
 		 473 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.72 
 
 		 487 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  47.6 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  47.6 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  47.6 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  47.92 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  47.6 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  47.6 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.63 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  46.73 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  47.92 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  46.76 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  48.29 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  46.63 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  48.05 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  47.8 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  49.24 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  48.05 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  48.05 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  48.05 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  45.33 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  47.8 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  47.61 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  45.59 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  48.66 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  45.48 
 
 		 482 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  45.26 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  47.93 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  46.12 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  45.01 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  47.07 
 
 		 483 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  44.96 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  43.03 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  43.28 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  43.28 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  47.8 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  42.35 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  40.05 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  41.71 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  41.71 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  39.81 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  39.81 
 
 		 429 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  43.24 
 
 		 433 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.07 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  41.48 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.86 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.86 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  40.82 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  40.56 
 
 		 429 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  36.96 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>