More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3801 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  90.23 
 
 		 431 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 434 aa  820    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  67.76 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  67.37 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  64.06 
 
 		 553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  65.72 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  65.72 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  65.72 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  65.72 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  65.72 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  65.72 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  62.47 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  65.72 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  61.41 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  60.85 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  61.08 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  64.07 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  64.07 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  61.08 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  64.22 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  60.85 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  64.07 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  63.12 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  60.85 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  63.12 
 
 		 435 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  60.61 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  60.61 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  59.86 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  60.61 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  60.56 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  60.95 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  62.17 
 
 		 428 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  64.45 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  62.82 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  60.67 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  62.5 
 
 		 435 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  61.9 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  60.14 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  62.5 
 
 		 483 aa  474  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  58.59 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  57.93 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  57.69 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  52.47 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  54.95 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  53.41 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  46.39 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  46.93 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  43.65 
 
 		 443 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  48.58 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  44.23 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  42.34 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  42.18 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  44.74 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  44.74 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  44.74 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  45.86 
 
 		 445 aa  276  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  43.12 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  43.97 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  42.22 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  44.63 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  42.42 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 		 492 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 		 436 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  43.26 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  40.09 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  39.82 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  37.91 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.28 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  44.17 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  37.44 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  37.44 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 		 487 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.01 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.01 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  37.29 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  38.42 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  36.94 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.01 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  40.85 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  38.18 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  38.42 
 
 		 429 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  36.06 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  37.18 
 
 		 429 aa  246  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  36.06 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  39.81 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  38.18 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  38.72 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  39.81 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  38.18 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  37.53 
 
 		 429 aa  243  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  37.53 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>