More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6670 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  77.58 
 
 
455 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  100 
 
 
473 aa  916    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.94 
 
 
492 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  66 
 
 
487 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  64.85 
 
 
490 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  62.64 
 
 
443 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.75 
 
 
487 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  58.33 
 
 
468 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  61.28 
 
 
457 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  47.11 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  43.89 
 
 
469 aa  351  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  47.03 
 
 
433 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  47.58 
 
 
414 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  48.93 
 
 
433 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  48.93 
 
 
433 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  48.93 
 
 
433 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  46.09 
 
 
445 aa  335  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  46.44 
 
 
429 aa  333  6e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  45.47 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  45.62 
 
 
425 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  44.65 
 
 
450 aa  323  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  44.92 
 
 
441 aa  322  8e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  43.66 
 
 
463 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  45.37 
 
 
450 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  43.76 
 
 
428 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  42.86 
 
 
435 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  46.59 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  42.17 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  44.52 
 
 
472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  40 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  43.26 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  41.57 
 
 
553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  42.23 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  42.68 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  42.44 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  42.68 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  42.68 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  42.68 
 
 
442 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  42.44 
 
 
442 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  41.09 
 
 
432 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  42.68 
 
 
442 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  42.44 
 
 
442 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  42.08 
 
 
442 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  42.09 
 
 
482 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  41.67 
 
 
435 aa  299  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  41.63 
 
 
434 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  41.67 
 
 
435 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  42.68 
 
 
435 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  41.38 
 
 
435 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  41.08 
 
 
433 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  41.63 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  42.68 
 
 
435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  42.68 
 
 
435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  40.65 
 
 
435 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
435 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  40.65 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  39.26 
 
 
435 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  39.77 
 
 
428 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  41.35 
 
 
434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  43.09 
 
 
428 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  43.09 
 
 
428 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  41.51 
 
 
483 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  39.82 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  39.2 
 
 
431 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.38 
 
 
415 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  40.73 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  40.24 
 
 
477 aa  269  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  39.27 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  39.06 
 
 
429 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  38.35 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  38.35 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  34.69 
 
 
429 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  34.4 
 
 
429 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  38.29 
 
 
453 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  34.94 
 
 
457 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  33.94 
 
 
429 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  33.72 
 
 
429 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  33.63 
 
 
429 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  35.05 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  33.63 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  33.94 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  33.56 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  33.56 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  33.56 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  33.63 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  33.94 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  34.42 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>