More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1196 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  92.87 
 
 
477 aa  858    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  100 
 
 
477 aa  947    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  80.62 
 
 
459 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  63.36 
 
 
442 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  63.59 
 
 
442 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  62.12 
 
 
439 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  63.12 
 
 
442 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  63.12 
 
 
442 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  61.96 
 
 
553 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  62.41 
 
 
442 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  63.12 
 
 
442 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  62.88 
 
 
442 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  62.88 
 
 
442 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  62.88 
 
 
442 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  63.62 
 
 
435 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  63.85 
 
 
435 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  61.7 
 
 
428 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  60.99 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  62.44 
 
 
435 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  62.03 
 
 
435 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  61.37 
 
 
428 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  63.21 
 
 
435 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  62.97 
 
 
435 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  61.74 
 
 
435 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  61.18 
 
 
433 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  60.8 
 
 
435 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  61.03 
 
 
435 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  60.8 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  61.27 
 
 
434 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  60.8 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  63.57 
 
 
428 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  63.57 
 
 
428 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  62.56 
 
 
428 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  61.27 
 
 
434 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  56.05 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  52.43 
 
 
482 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  54.95 
 
 
434 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  53.9 
 
 
431 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  53.56 
 
 
483 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  53.63 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  53.4 
 
 
426 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  53.4 
 
 
426 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  43.13 
 
 
468 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  43.93 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  43.46 
 
 
443 aa  309  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  44.34 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  43.39 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  42.31 
 
 
433 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  42.31 
 
 
433 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  42.31 
 
 
433 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  44.6 
 
 
445 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  44.1 
 
 
457 aa  296  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 
487 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  42.15 
 
 
469 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  46.44 
 
 
453 aa  294  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  44.34 
 
 
433 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
492 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  39.41 
 
 
455 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  41.5 
 
 
429 aa  289  8e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  43.1 
 
 
463 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  44.94 
 
 
441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  44.5 
 
 
472 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 
425 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  43.51 
 
 
450 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  45.23 
 
 
454 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  37.29 
 
 
429 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.95 
 
 
429 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  40.53 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  38.26 
 
 
428 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  38.26 
 
 
428 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  42.31 
 
 
429 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  36.19 
 
 
429 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  44.01 
 
 
436 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  37.05 
 
 
429 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  37.05 
 
 
429 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  36.72 
 
 
429 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  36.72 
 
 
429 aa  269  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  36.45 
 
 
429 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  37.05 
 
 
429 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  36.99 
 
 
432 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  36.99 
 
 
432 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  37.05 
 
 
429 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  37.29 
 
 
429 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  40.9 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  37.56 
 
 
430 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  36.99 
 
 
422 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  37.56 
 
 
438 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  37.56 
 
 
438 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  37.56 
 
 
438 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  37.56 
 
 
427 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  37.56 
 
 
427 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  37.56 
 
 
427 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  37.56 
 
 
427 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  37.33 
 
 
427 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  37.35 
 
 
429 aa  264  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>