More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1317 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  100 
 
 		 422 aa  823    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  69.76 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  68.29 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  69.52 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  69.52 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  68.33 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  67.86 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  67.86 
 
 		 429 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  69.01 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  69.01 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  69.01 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  69.76 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  69.25 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  69.01 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  66.2 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  65.02 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  61.83 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  57.3 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  57.71 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  57.48 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  50.82 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  51.06 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  51.06 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  49.4 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  49.05 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  48.67 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  51.65 
 
 		 391 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  51.07 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  50.97 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  46.38 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  44.93 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  44.19 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  45.56 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  44.7 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  44.7 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  45.33 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  45.33 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  46.92 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  45.09 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  45.09 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  44.79 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  45.09 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  46.12 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  46.12 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  43.27 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.85 
 
 		 432 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  44.29 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  43.57 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  43.73 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  43.54 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  44.73 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  44.22 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  44.22 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  44.78 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  42.12 
 
 		 553 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  44.01 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  43.04 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  42.46 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  43.42 
 
 		 425 aa  299  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  42.01 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  38.73 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  41.75 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  38.82 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  42 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  38.57 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  38.33 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  42.35 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  42.35 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  40 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  38.89 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  40.35 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  38.89 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  39.19 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  41.63 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  40.33 
 
 		 439 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  38.31 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  39.8 
 
 		 412 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  39.58 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  39.58 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  39.62 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  40.69 
 
 		 411 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  38.85 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  38.85 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  38.85 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  38.52 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  39.28 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  39.34 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>