More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0485 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  100 
 
 
458 aa  899    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  60.49 
 
 
433 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  58.97 
 
 
428 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  57.3 
 
 
422 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  55.48 
 
 
429 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  55.48 
 
 
429 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  55.48 
 
 
429 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  55.48 
 
 
429 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  55.26 
 
 
429 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  53.88 
 
 
429 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  54.32 
 
 
429 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  54.81 
 
 
429 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  53.66 
 
 
428 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  53.66 
 
 
428 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  53.22 
 
 
429 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  53.22 
 
 
429 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  54.02 
 
 
429 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  55.18 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  50.11 
 
 
432 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  50.32 
 
 
432 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  49.89 
 
 
421 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  46.8 
 
 
420 aa  393  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  46.81 
 
 
423 aa  388  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  45.11 
 
 
432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  45.11 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  45.11 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  42.21 
 
 
438 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  41.94 
 
 
457 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  42.21 
 
 
427 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  42.21 
 
 
427 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 
434 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  41.99 
 
 
438 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  41.99 
 
 
438 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  41.99 
 
 
427 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  41.99 
 
 
427 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  41.77 
 
 
427 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  42.27 
 
 
427 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  41.99 
 
 
430 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  42.36 
 
 
427 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  42 
 
 
430 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.37 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  41.68 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  41.68 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  42.7 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  40.5 
 
 
423 aa  334  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  48.18 
 
 
391 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  40.99 
 
 
423 aa  316  4e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.2 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  38.05 
 
 
443 aa  296  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  38.51 
 
 
415 aa  296  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  37.39 
 
 
430 aa  286  4e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  39.72 
 
 
399 aa  279  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  39.72 
 
 
399 aa  279  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  36.87 
 
 
403 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  39.63 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  37.2 
 
 
409 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  36.32 
 
 
430 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  37.78 
 
 
433 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  37.5 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  35.65 
 
 
553 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  36.16 
 
 
395 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  34.65 
 
 
428 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  35.17 
 
 
403 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  34.28 
 
 
442 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  34.28 
 
 
442 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  34.43 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  35.65 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  34.06 
 
 
442 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  34.06 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  34.28 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  34.06 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  35.2 
 
 
436 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  33.84 
 
 
442 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  34.14 
 
 
442 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  32.97 
 
 
439 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  35.49 
 
 
441 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl658  xanthine/uracil permease  33.78 
 
 
464 aa  246  4e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  37.93 
 
 
453 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  33.92 
 
 
435 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  33.48 
 
 
428 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  34.07 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  38.06 
 
 
416 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  35 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  35.7 
 
 
425 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  33.62 
 
 
428 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2188  uracil-xanthine permease  37.27 
 
 
387 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>