More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0910 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  78.92 
 
 
433 aa  681    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  100 
 
 
428 aa  834    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  58.97 
 
 
458 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  61.39 
 
 
429 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  61.63 
 
 
428 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  61.63 
 
 
428 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  60.67 
 
 
429 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  61.83 
 
 
422 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  61.15 
 
 
429 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  61.39 
 
 
429 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  61.63 
 
 
429 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  60.91 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  61 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  53.77 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  54.01 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  51.17 
 
 
423 aa  409  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  50.35 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  50.72 
 
 
432 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  50 
 
 
432 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  50 
 
 
432 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  52.99 
 
 
421 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  45.65 
 
 
457 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  49.39 
 
 
434 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  48 
 
 
427 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  48 
 
 
427 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  47.75 
 
 
438 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  47.75 
 
 
438 aa  345  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  47.75 
 
 
438 aa  345  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  47.5 
 
 
427 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  47.75 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  47.75 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 
430 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  47.5 
 
 
427 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  47.75 
 
 
427 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  44.78 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  44.84 
 
 
435 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  46.67 
 
 
432 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  44.84 
 
 
435 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  46.35 
 
 
391 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  43.66 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  44.29 
 
 
434 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  41.57 
 
 
423 aa  315  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  43.83 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  41.25 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  41.25 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  38.78 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  40.52 
 
 
430 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  38.63 
 
 
415 aa  296  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  42.27 
 
 
423 aa  292  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  41.51 
 
 
414 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  43.13 
 
 
425 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  42.33 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  39.75 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  41.75 
 
 
416 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  39.71 
 
 
425 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  39.71 
 
 
425 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  41.69 
 
 
409 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  40.05 
 
 
417 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  38.55 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  37.74 
 
 
417 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  42.13 
 
 
411 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  37.79 
 
 
553 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  37.14 
 
 
415 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  38.32 
 
 
414 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  37.92 
 
 
416 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  38.27 
 
 
409 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  38.78 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  37.99 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  39.39 
 
 
421 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  39.39 
 
 
421 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  38.3 
 
 
428 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  40.1 
 
 
409 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  39.14 
 
 
424 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  38.79 
 
 
427 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  37.77 
 
 
421 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  37.69 
 
 
403 aa  259  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  38.54 
 
 
427 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  37.85 
 
 
411 aa  257  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  37.15 
 
 
427 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  37.26 
 
 
424 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  37.53 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  39.8 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  38.48 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  38.28 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  37.59 
 
 
419 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  38.33 
 
 
436 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  39.09 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>