More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0765 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0765  uracil permease  100 
 
 
430 aa  834    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  89.53 
 
 
435 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  89.53 
 
 
435 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  58.91 
 
 
427 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  58.67 
 
 
438 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  58.41 
 
 
438 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  58.67 
 
 
438 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  58.43 
 
 
427 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  58.41 
 
 
427 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  58.67 
 
 
427 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  58.67 
 
 
427 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  58.67 
 
 
427 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  57.96 
 
 
430 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  57.78 
 
 
427 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  57.78 
 
 
434 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  56.12 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  50.35 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  51.19 
 
 
423 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  48.58 
 
 
423 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  49.16 
 
 
443 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  46.23 
 
 
423 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  50.8 
 
 
434 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  49.19 
 
 
432 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  49.19 
 
 
432 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  45.9 
 
 
433 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  48.96 
 
 
432 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  45.24 
 
 
432 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  45.48 
 
 
432 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  46.79 
 
 
422 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  45.76 
 
 
429 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  48.05 
 
 
415 aa  345  7e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  44.26 
 
 
429 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  45.99 
 
 
441 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  47.38 
 
 
425 aa  341  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  42.89 
 
 
429 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  46.46 
 
 
457 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  42 
 
 
458 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  44.98 
 
 
429 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  44.02 
 
 
429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  44.02 
 
 
429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  43.87 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  43.87 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  44.78 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  44.02 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  44.26 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  43.52 
 
 
429 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  43.06 
 
 
429 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  43.78 
 
 
429 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  42.82 
 
 
429 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  44.63 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  44.99 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  43.36 
 
 
427 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  44.29 
 
 
418 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  45.48 
 
 
416 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  44.26 
 
 
425 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  44.2 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  45.16 
 
 
425 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  44.91 
 
 
415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  44.39 
 
 
403 aa  319  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  43.7 
 
 
417 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  45.3 
 
 
409 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  46.72 
 
 
433 aa  315  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  44.69 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  42.96 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  43.24 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  42.2 
 
 
399 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  42.2 
 
 
399 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  43.78 
 
 
412 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  45.41 
 
 
413 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  44.68 
 
 
414 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  43.97 
 
 
409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  41.98 
 
 
412 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  45.72 
 
 
430 aa  308  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  41.87 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  41.94 
 
 
424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  42.12 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl658  xanthine/uracil permease  39.51 
 
 
464 aa  303  5.000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  41.39 
 
 
420 aa  302  7.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  39.8 
 
 
419 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  42.18 
 
 
421 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  41.63 
 
 
425 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  42.16 
 
 
421 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  42.18 
 
 
421 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  41.38 
 
 
427 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  41.13 
 
 
427 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  41.63 
 
 
423 aa  300  3e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  40.63 
 
 
395 aa  300  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  42.14 
 
 
406 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  40.34 
 
 
411 aa  299  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  41.83 
 
 
411 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  38.39 
 
 
469 aa  297  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  41.69 
 
 
417 aa  297  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>