More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1115 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  78.92 
 
 
428 aa  681    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  100 
 
 
433 aa  843    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  60.49 
 
 
458 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  65.02 
 
 
422 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  61.39 
 
 
429 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  59.68 
 
 
429 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  59.68 
 
 
429 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  59.68 
 
 
429 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  59.07 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  59.68 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  59.07 
 
 
429 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  59.45 
 
 
429 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  59.07 
 
 
428 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  59.07 
 
 
428 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  59.3 
 
 
429 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  57.44 
 
 
429 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  57.44 
 
 
429 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  58.62 
 
 
429 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  59.23 
 
 
429 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  58.84 
 
 
429 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  54.14 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  54.61 
 
 
432 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  52.11 
 
 
420 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  50.93 
 
 
423 aa  415  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  53.86 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  51.45 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  50.72 
 
 
432 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  50.72 
 
 
432 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  51.82 
 
 
434 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  46.94 
 
 
457 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  48.19 
 
 
427 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  46.19 
 
 
438 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  46.19 
 
 
427 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  46.19 
 
 
427 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  46.59 
 
 
435 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  46.59 
 
 
435 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  45.96 
 
 
427 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  47.82 
 
 
430 aa  358  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  45.96 
 
 
438 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  45.96 
 
 
438 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  45.96 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  45.73 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  46.42 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  45.9 
 
 
430 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  46.21 
 
 
432 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  45.95 
 
 
434 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  43.69 
 
 
423 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  46.33 
 
 
391 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  43.03 
 
 
399 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  43.03 
 
 
399 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  42.52 
 
 
423 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  40.34 
 
 
415 aa  312  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  41.22 
 
 
403 aa  309  8e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  42.59 
 
 
430 aa  308  9e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  42.21 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  42.24 
 
 
423 aa  302  9e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  42.65 
 
 
414 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  42.3 
 
 
433 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  44.2 
 
 
425 aa  286  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  39.11 
 
 
425 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  39.34 
 
 
425 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  40.36 
 
 
414 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  37.56 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  39.81 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  37.97 
 
 
553 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  40.65 
 
 
425 aa  272  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  41.52 
 
 
416 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  40.29 
 
 
428 aa  272  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  40.83 
 
 
409 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  39.85 
 
 
411 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  38.98 
 
 
417 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  38.35 
 
 
417 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  38.44 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  39.3 
 
 
411 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  38.44 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  38.44 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  38.44 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  38.21 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  38.44 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  38.44 
 
 
435 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  38.94 
 
 
403 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  38.74 
 
 
417 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  39.85 
 
 
411 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  38.01 
 
 
442 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  38.01 
 
 
442 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  37.82 
 
 
427 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  38.01 
 
 
442 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  37.82 
 
 
427 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  36.53 
 
 
439 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  37.35 
 
 
435 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  39.03 
 
 
395 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  39.09 
 
 
419 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  38.26 
 
 
442 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  37.67 
 
 
424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>