More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5296 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  89.52 
 
 
421 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  89.52 
 
 
421 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  87.38 
 
 
406 aa  698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  87.8 
 
 
425 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  89.81 
 
 
424 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  89.31 
 
 
424 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  89.29 
 
 
421 aa  741    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  100 
 
 
427 aa  831    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  99.3 
 
 
427 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  75.42 
 
 
420 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  65.34 
 
 
418 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  66.58 
 
 
427 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  65.93 
 
 
409 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  62.77 
 
 
441 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  61 
 
 
417 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  64.55 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  64.79 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  64.55 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  61.96 
 
 
417 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  64.01 
 
 
416 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  64.01 
 
 
416 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  64.25 
 
 
416 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  64.01 
 
 
416 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  66.25 
 
 
412 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  64.44 
 
 
412 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  63.59 
 
 
415 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  61.39 
 
 
416 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  60.43 
 
 
417 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  65.99 
 
 
407 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  62.93 
 
 
418 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  64.69 
 
 
411 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  59.62 
 
 
411 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  65.24 
 
 
408 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  60.29 
 
 
425 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  60.29 
 
 
425 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  65.66 
 
 
409 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  58.33 
 
 
416 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  60.25 
 
 
415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  59.5 
 
 
414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  56.87 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  59.9 
 
 
412 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  58.6 
 
 
421 aa  448  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  59.85 
 
 
411 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  60.4 
 
 
413 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  58.13 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  55.17 
 
 
412 aa  437  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  55.17 
 
 
411 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  52.57 
 
 
419 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  56.36 
 
 
419 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  50.5 
 
 
395 aa  368  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  48.14 
 
 
415 aa  355  6.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  47.81 
 
 
409 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  47.43 
 
 
403 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  48.27 
 
 
399 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  48.27 
 
 
399 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  44.79 
 
 
427 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  44.55 
 
 
438 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  44.55 
 
 
427 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  44.55 
 
 
438 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  44.55 
 
 
438 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  43.33 
 
 
430 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  44.55 
 
 
427 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  44.55 
 
 
427 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  45.73 
 
 
427 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  44.31 
 
 
427 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  43.99 
 
 
427 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  44.04 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  44.96 
 
 
403 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  46.54 
 
 
433 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  40.76 
 
 
435 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  40.76 
 
 
435 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  41.45 
 
 
436 aa  302  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  42.26 
 
 
434 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 
432 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  41.13 
 
 
430 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  41.45 
 
 
436 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  42.01 
 
 
457 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  41.32 
 
 
447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.95 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  44.67 
 
 
394 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.95 
 
 
429 aa  282  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  39.8 
 
 
428 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  39.8 
 
 
428 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  40.15 
 
 
429 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  40.15 
 
 
429 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  39.55 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  40.15 
 
 
429 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  39.05 
 
 
429 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  40.15 
 
 
429 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  38.81 
 
 
429 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  41.12 
 
 
432 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  40.97 
 
 
432 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>